生命物理科学(薬品物理化学)

研究実績

【2020年~2024年】

・Quantification of HPV16 E7 Oncoproteins in Urine Specimens from Women with Cervical Intraepithelial Neoplasia, D Makioka, M Inada, M Awano, E Saito, T Shinoda, S Abe, T Yoshimura, M Müller, T Sasagawa , E Ito, Microorganisms, 12, 1205 (2024).

・Changes in protein phosphorylation by insulin administration in the central nervous system of the gastropod mollusk Lymnaea stagnalis, J Nakai, K Namiki, Y Totani, S Yasumasu, T Yoshimura, T Aoki, E Ito, Biophys. Physicobiol., (2023), https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v20.0038

・Advanced Detection Method for Dengue NS1 Protein Using Ultrasensitive ELISA with Thio-NAD Cycling, P-K Chen, J-H Chang, L-Y Ke, J-K Kao, C-H Chen, R-C Yang, T Y, E Ito, Viruses 15, 1894 (2023),  https://doi.org/10.3390/v15091894

・Removal of Soluble ACE2 in VeroE6 Cells by 17β-Estradiol Reduces SARS-CoV2 Infectivity,  Y Kyosei, T Yoshimura, E Ito, Biol. Pharm. Bull., 46, 1842-1845 (2023).

・Synthesis and biological evaluation of coumarin derivatives as selective CYP2A6 inhibitors, Y Yamaguchi, N Nishizono, D Kobayashi, T Yoshimura, K Wada, K Kobayashi, K Oda, Bioorg. Med. Chem. Lett., 86, 129206 (2023).

・Expression, Purification, and preliminary X-ray Crystal Diffraction Analysis of the Saccharomyces cerevisiae Phosphomevalonate Kinase, C Suzuki, M Nagase, T Yoshimura, M Ishizaka, T Ose, M Yao, C Okada, Crystallography Reports, 68, 57-61 (2023).

・Expression, Purification, and preliminary X-ray Crystal Diffraction Analysis of the Saccharomyces cerevisiae Phosphomevalonate Kinase, C Suzuki, M Nagase, T Yoshimura, M Ishizaka, T Ose, M Yao, C Okada, Crystallography Reports, 68, 57-61 (2023).

・Non-amplification nucleic acid detection with thio-NAD cycling, Journal of Microbiological Methods, S Yamura, N Kawada, S Yamakado, Y Kyosei, S Watabe, T Yoshimura, Y Murase, S Mitara, E Ito, J. Microbiol. Methods, 204, 106647 (2023).

・Gastric Cancer Cell-Derived Exosomal GRP78 Enhances Angiogenesis upon Stimulation of Vascular Endothelial Cells, K Iha, A Sato, H-Y Tsai, H Sonoda,  S Watabe, T Yoshimura, M-W Lin, E Ito, Curr. Issues Mol. Biol., 44, 6145–6157 (2022).

・Ultrasensitive ELISA detection of proteins in separated lumen and membrane fractions of cancer cell exosomes, K Iha, N Tsurusawa, H-Y Tsaibc, M-W Lin, H Sonodae, S Watabe, T Yoshimura, E Ito,  Anal. Biochem., 654 (1) , 114831 (2022).

・Modified ELISA for Ultrasensitive Diagnosis, N Tsurusawa, J Chang, M Namba, D Makioka, S Yamura, K Iha, Y Kyosei, S Watabe, T Yoshimura, E Ito, J. Clin. Med., 10, 5197-5210 (2021).

・Ultrasensitive Detection of SARS-CoV-2 Spike Proteins Using the Thio-NAD Cycling Reaction: A Preliminary Study before Clinical Trials, Y Kyosei, M Namba, D Makioka, A Kokubun, S Watabe, T Yoshimura, T Sasaki, T Shioda, E Ito, Microorganisms, 9 (11), 2214-2222 (2021).

・Improved Detection Sensitivity of an Antigen Test for SARS-CoV-2 Nucleocapsid Proteins with Thio-NAD Cycling, Y Kyosei, M Namba, S Yamura, S Watabe, T Yoshimura, T Sasaki, T Shioda, E Ito, Biol. Pharm. Bull.,44 (9), 1332-1336 (2021).

・Zeptomole detection of an enzyme by a simple colorimetric method, K Iha Y Kyosei, M Namba, D Makioka, S Yamura, S Watabe, T Yoshimura, E Ito, Anal. Sci., 37, 1469-1472 (2021).

・Antigen tests for COVID-19, Y Kyosei, S Yamura, M Namba, T Yoshimura, S Watabe, E Ito Biophys. Physicobiol., 18, 28–39 (2021).

・Early diagnosis with ultrasensitive ELISA, E Ito, K Iha, T Yoshimura, K Nakaishi, S Watabe, Advances in Clinical Chemistry, 101,121-133 (2021).

・An Adult Case of Generalized Convulsions Caused by the Ingestion of Ginkgo biloba Seeds with Alcohol, F Azuma, K Nokura, T Kako, D Kobayashi, T Yoshimura, K Wada, Internal Medicine, 59(12), 1555-1558 (2020).

・Flexible NAD+ binding in deoxyhypusine synthase reflects the dynamic hypusine modification of translation factor IF5A, m cHEN, z Gai, C Okada, Y ye, M Yao, Int. J. Mol Sci., 21 (15), 5509 (2020).

 

【2015年~2019年】

・Ultrasensitive ELISA Developed for Diagnosis, K Iha,M Inada, N Kawada, K Nakaishi, S Watabe, Y H Tan, C Shen, L-Y Ke, T Yoshimura, E Ito, Diagnostics 9,78 (2019).

・Urinary adiponectin as a new diagnostic index for chronic kidney disease due to diabetic nephropathy, S Yamakado, H Cho, M Inada, M Morikawa, Y-H Jiang, K Saito, K Nakaishi, S Watabe, H Takagi, M Kaneda, A Nakatsuma, M Ninomiya, H Imachi, T Arai, T Yoshimoto, K Murao, J-H Chang, S-M Chen, Y-C Shih, M-J Zeng, L-Y Ke, C-H Chen,T Yoshimura, T Miura, E Ito, BMU Open Diab Res Care, 0:e000661, (2019).

・Synthesis of N-ω-Phenylalkyl-4-(p-Chlorophenyl)-Piperidin-4-ol Analogues with Potent Antiproliferative Activity Against HCT-116 Cells, N Hatae, E Kujime, K Yano, M Kizuka, R Ashida, T Choshi,T Nishiyama, C Okada, T Iwamura, T Yoshimura, Heterocycles 97(1), 560-568 (2018).

・Synthesis and detection by HPLC of 3-oxohexadecanoyl-CoA for the study of peroxisomal bifunctional proteins, S Tsuchida, A Tenma, N Hamaue, T Murai, T Yoshimura, T Aoki, T Kurosawa, J. Oleo Sci., 66 (7), 745-751 (2017).

・Synthesis of β-Dihydropyrrolyl and β-Pyrrolyl Acrylates and Their Antiproliferative Activity against HCT-116 and HL-60 Cells, N Hatae, Y Sakai, K Yorozu, C Okada, M Yoshimatsu, T Yoshimura,   Heterocycles,95 (1) 557 -567 (2017).

・Ultrasensitive detection of proteins and sugars at single-cell level, S Watabe, M Morikawa, M Kaneda, K Nakaishi, A Nakatsuma, M Ninomiya, T Yoshimura, T Miura, E Ito, Commun. Integr. Biol., 9: e1124201 (2016).

・Antiproliferative activity of hybrid compounds between 6-methoxy-3-(4-methoxyphenyl)-1H-indole and 4-phenylpiperidine against HCT-116 and HL-60 cells, N Hatae, T Nishiyama, S Tamura, R Yamamoto, A Matsui, H Shinchi, S Hibino, C Okada, T Yoshimura, T Choshi, E Toyota, Heterocycles, 93 (1), 440-452 (2016).

・Concise synthesis of carbazole-1,4-quinones and evaluation of their antiproliferative activity against HCT-116 and HL-60 cells, T Nishiyama, N Hatae, T Yoshimura, S Takaki, T Abe, M Ishikura, S Hibino, T Choshi, Eur. J. Med. Chem., 121, 561-577 (2016).

・学部が支援する教育改革-教員および学生支援による教育補完プログラムの導入和田啓爾、吉村昭毅、薬学雑誌 135(1), 93-97 (2015).

・Detection of HIV-1 p24 at Attomole Level by Ultrasensitive ELISA with Thio-NAD Cycling, A Nakatsuma, M Kaneda, H Kodama, M Morikawa, S Watabe, K Nakaishi, M Yamashita, T Yoshimura, T Miura, M Ninomiya1, E Ito, PLoS One, 10 (6), e0131319 (2015) .

・Decrease in pyridoxal-5’-phosphate concentration and increase in pyridoxal concentration in rat plasma by 4’-O-methylpyridoxine administration, D Kobayashi, T Yoshimura, A Johno, M Ishikawa, K Sasaki, K Wada, Nurition Res., 35, 637-642 (2015).

・Subattomole detection of adiponectin in urine by ultrasensitive ELISA coupled with thio-NAD cycling,  M Morikawa, R Naito, K Mita, S Watabe, K Nakaishi1, T Yoshimura, T Miura, Se Hashida, E Ito, Biophys.  Physicobiol., 12, 79–86 (2015).

・Immunoreactive insulin in DM-patient sera detected by ultrasensitive ELISA with thio-NAD cycling,    E Ito, M Kaneda, H Kodama, M Morikawa, M Tai, K Aoki, S Watabe, K Nakaish, S Hashida, S Tada, N Kuroda, H Imachi, K Murao, M Yamashita, T Yoshimura, T Miura, BioTechniques, 59, 359-367 (2015).

研究概要

1) タンパク質のX線結晶構造解析
酵素(タンパク質)はある定まった立体構造を形成することにより、相互作用をするべき相手と確実に結合し、高い基質特異性を備えた触媒として機能する。よって酵素や、酵素と基質の複合体の立体構造を決定できれば、酵素の基質認識や反応機構に関する様々な知見が得られる。また、タンパク質の立体構造に基づく創薬(Structure-Based Drug Design, SBDD)のために有用な情報を得ることが出来る。そこで、真菌類のエルゴステロール生合成に関わる酵素や、グラム陰性菌のエンドトキシン生合成に関わる酵素をターゲットとしてX線結晶構造解析を行い、酵素やその変異体、さらに酵素‐基質複合体などの複数の立体構造と比較していくことで、これらの生合成経路の詳細を明らかにすることを目指し研究している。エルゴステロール合成酵素Erg8p、Erg12p、Erg27pにおいては、SBDDによる阻害剤の合成は抗真菌薬に繋がることが期待でき、また酵素機能の解明はエルゴステロール生合成のみならずヒトの類縁酵素(コレステロール生合成酵素)の詳細を明らかにするのに役立つと考えられることから、機能解析、構造解析を進めている。エンドトキシン合成酵素LpxB、LpxHには類似した酵素がヒトには存在していないため、構造情報から新規抗菌薬につながる特異性の高い阻害剤の合成が期待できる。

2) 3α-ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ (3α-HSD)を用いるチオNADサイクリング反応の高効率化と各種疾患診断法への応用
3α-HSD / NADH / チオNADから成るチオNADサイクリングはユニークな酵素サイクリング系で、1種類の酵素のみで正反応と逆反応を1分間あたり数百から数千cycle繰り返す。従って、この反応系を利用することにより、これまで測定が困難であった極微量成分、ウィルス等の検出及び増幅定量が可能となる。現在、検出器系を改良し、さらに高感度化を図るととともに、開発した検出系をELISA等と組み合わせた各種疾患診断法(COVID-19等)の開発並びにPOCTへの応用について検討を行っている。

3) 薬毒物の代謝的活性化機構の解析
ヒト体内における薬毒物の解毒代謝機構の解析と、体内において生成する薬毒物の活性代謝物(発がんや臓器障害誘発物質)と高分子(DNA及びタンパク質)複合体の構造及びそれらの生成機構をLC-MS/MS等を利用して解析している。